MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002944	GGC	2	6	148233	148238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3502	NC_002944	CGG	2	6	148250	148255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3503	NC_002944	CAGCG	2	10	148273	148282	20 %	0 %	40 %	40 %	41406240
3504	NC_002944	CGG	2	6	148340	148345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3505	NC_002944	GCCG	2	8	148373	148380	0 %	0 %	50 %	50 %	41406240
3506	NC_002944	GCG	2	6	148466	148471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3507	NC_002944	CCG	2	6	148502	148507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3508	NC_002944	GCG	2	6	148534	148539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3509	NC_002944	ACG	2	6	148540	148545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3510	NC_002944	CGC	2	6	148551	148556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3511	NC_002944	CGG	2	6	148571	148576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3512	NC_002944	ACG	2	6	148586	148591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3513	NC_002944	GC	3	6	148618	148623	0 %	0 %	50 %	50 %	41406240
3514	NC_002944	CGG	2	6	148655	148660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3515	NC_002944	CGG	2	6	148673	148678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3516	NC_002944	CGG	2	6	148688	148693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406240
3517	NC_002944	CGA	2	6	148754	148759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3518	NC_002944	AAC	2	6	148774	148779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406240
3519	NC_002944	CAG	2	6	148797	148802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3520	NC_002944	CCA	2	6	148817	148822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406240
3521	NC_002944	GCC	2	6	148828	148833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3522	NC_002944	CCGG	2	8	148850	148857	0 %	0 %	50 %	50 %	41406240
3523	NC_002944	GCC	2	6	148881	148886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406240
3524	NC_002944	CAG	2	6	148890	148895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3525	NC_002944	GCA	2	6	148901	148906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3526	NC_002944	GTG	3	9	148942	148950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406240
3527	NC_002944	GGT	2	6	148955	148960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406240
3528	NC_002944	CGA	2	6	148988	148993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3529	NC_002944	CAG	3	9	149019	149027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3530	NC_002944	CGA	2	6	149039	149044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3531	NC_002944	GGTG	2	8	149058	149065	0 %	25 %	75 %	0 %	41406240
3532	NC_002944	GCGG	2	8	149094	149101	0 %	0 %	75 %	25 %	41406240
3533	NC_002944	CGA	2	6	149112	149117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406240
3534	NC_002944	ACT	2	6	149267	149272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406241
3535	NC_002944	ATG	2	6	149290	149295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406241
3536	NC_002944	CTG	2	6	149332	149337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406241
3537	NC_002944	TCA	2	6	149363	149368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406241
3538	NC_002944	CGG	2	6	149373	149378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406241
3539	NC_002944	CAC	2	6	149400	149405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406241
3540	NC_002944	AAG	2	6	149416	149421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406241
3541	NC_002944	ACG	2	6	149426	149431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406241
3542	NC_002944	GGT	2	6	149642	149647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3543	NC_002944	TGC	2	6	149716	149721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3544	NC_002944	CGACGT	2	12	149723	149734	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3545	NC_002944	GGT	2	6	149753	149758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3546	NC_002944	GCT	2	6	149762	149767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3547	NC_002944	GCT	2	6	149795	149800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3548	NC_002944	GTG	2	6	149889	149894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406242
3549	NC_002944	GCT	2	6	149909	149914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3550	NC_002944	GGC	2	6	149930	149935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3551	NC_002944	CG	3	6	149956	149961	0 %	0 %	50 %	50 %	41406242
3552	NC_002944	CGT	2	6	150008	150013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3553	NC_002944	CGG	2	6	150056	150061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3554	NC_002944	CGA	2	6	150122	150127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3555	NC_002944	GCA	2	6	150188	150193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3556	NC_002944	ACG	2	6	150226	150231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3557	NC_002944	GGA	2	6	150233	150238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3558	NC_002944	TGC	2	6	150244	150249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3559	NC_002944	GCG	2	6	150274	150279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3560	NC_002944	AGG	2	6	150280	150285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3561	NC_002944	GCG	2	6	150286	150291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406242
3562	NC_002944	ACG	2	6	150301	150306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3563	NC_002944	CG	3	6	150322	150327	0 %	0 %	50 %	50 %	41406242
3564	NC_002944	CGC	2	6	150347	150352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406242
3565	NC_002944	GTT	2	6	150365	150370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41406242
3566	NC_002944	GGA	2	6	150371	150376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3567	NC_002944	AGG	2	6	150412	150417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406242
3568	NC_002944	CGT	2	6	150424	150429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406242
3569	NC_002944	GGT	2	6	150457	150462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3570	NC_002944	CGC	2	6	150463	150468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406243
3571	NC_002944	AGC	2	6	150497	150502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3572	NC_002944	CAC	2	6	150505	150510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406243
3573	NC_002944	GAC	2	6	150511	150516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3574	NC_002944	TAC	2	6	150542	150547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3575	NC_002944	CAG	2	6	150575	150580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3576	NC_002944	CTG	2	6	150581	150586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3577	NC_002944	GAA	2	6	150589	150594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406243
3578	NC_002944	GCA	2	6	150627	150632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3579	NC_002944	CGG	2	6	150682	150687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3580	NC_002944	CTG	2	6	150698	150703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3581	NC_002944	TGG	2	6	150768	150773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3582	NC_002944	AAG	2	6	150818	150823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406243
3583	NC_002944	GCG	2	6	150951	150956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3584	NC_002944	CAG	3	9	151004	151012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3585	NC_002944	CAT	2	6	151021	151026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3586	NC_002944	GGT	2	6	151052	151057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3587	NC_002944	TCA	2	6	151080	151085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406243
3588	NC_002944	TGG	2	6	151110	151115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406243
3589	NC_002944	GAG	2	6	151127	151132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406243
3590	NC_002944	GGC	2	6	151168	151173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406243
3591	NC_002944	AGG	2	6	151215	151220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406243
3592	NC_002944	GC	3	6	151270	151275	0 %	0 %	50 %	50 %	41406243
3593	NC_002944	CGA	2	6	151327	151332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406243
3594	NC_002944	ACGCA	2	10	151339	151348	40 %	0 %	20 %	40 %	41406243
3595	NC_002944	GTGGC	2	10	151456	151465	0 %	20 %	60 %	20 %	41406244
3596	NC_002944	CCG	2	6	151475	151480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3597	NC_002944	GTG	2	6	151525	151530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3598	NC_002944	GGC	2	6	151620	151625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406244
3599	NC_002944	TCG	2	6	151649	151654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3600	NC_002944	CG	3	6	151668	151673	0 %	0 %	50 %	50 %	41406244
3601	NC_002944	GCT	2	6	151677	151682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3602	NC_002944	TGC	2	6	151736	151741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3603	NC_002944	CGA	2	6	151758	151763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3604	NC_002944	TGG	2	6	151781	151786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3605	NC_002944	ACG	3	9	151813	151821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3606	NC_002944	TGC	3	9	151907	151915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3607	NC_002944	CCG	2	6	151916	151921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3608	NC_002944	GTG	2	6	151978	151983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406244
3609	NC_002944	CCT	2	6	152000	152005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41406244
3610	NC_002944	CTG	2	6	152023	152028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3611	NC_002944	TGC	2	6	152063	152068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3612	NC_002944	TGC	2	6	152078	152083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406244
3613	NC_002944	CGC	2	6	152109	152114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406244
3614	NC_002944	CGG	2	6	152143	152148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406244
3615	NC_002944	AGC	3	9	152161	152169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3616	NC_002944	GTC	2	6	152181	152186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3617	NC_002944	CAG	2	6	152205	152210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3618	NC_002944	AGC	2	6	152218	152223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3619	NC_002944	TCA	2	6	152234	152239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406245
3620	NC_002944	CGA	2	6	152249	152254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406245
3621	NC_002944	CGC	2	6	152272	152277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406245
3622	NC_002944	CCA	2	6	152351	152356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406245
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3734	NC_002944	ACTC	2	8	156247	156254	25 %	25 %	0 %	50 %	41406250
3735	NC_002944	CATCGT	2	12	156405	156416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	41406251
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3739	NC_002944	TGGGTG	2	12	156460	156471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406251
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3866	NC_002944	GTA	2	6	161640	161645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41406257
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3982	NC_002944	TGG	2	6	166530	166535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
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3984	NC_002944	GCC	2	6	166594	166599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3985	NC_002944	GAG	2	6	166691	166696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406262
3986	NC_002944	CG	4	8	166723	166730	0 %	0 %	50 %	50 %	41406262
3987	NC_002944	CGC	2	6	166741	166746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3988	NC_002944	TGC	2	6	166803	166808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3989	NC_002944	CCG	2	6	166809	166814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3990	NC_002944	TGGC	2	8	166853	166860	0 %	25 %	50 %	25 %	41406262
3991	NC_002944	TGG	2	6	166863	166868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3992	NC_002944	TGG	3	9	166878	166886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3993	NC_002944	TCA	2	6	166893	166898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406262
3994	NC_002944	CGC	2	6	166915	166920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3995	NC_002944	CGC	2	6	166993	166998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
3996	NC_002944	CGATG	2	10	167005	167014	20 %	20 %	40 %	20 %	41406262
3997	NC_002944	GCT	2	6	167020	167025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406262
3998	NC_002944	GGT	2	6	167032	167037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406262
3999	NC_002944	CGC	2	6	167053	167058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406262
4000	NC_002944	CGA	2	6	167088	167093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406262

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